生态建设和环境保护补偿机制，是指自然资源使用人或生态受益人在合法利用自然资源过程中，对自然资源所有权人或对生态保护付出代价者支付相应费用的固定做法。尽快建立一个合理的生态建设和环境保护补偿机制，对民族地区来说尤为重要和紧迫。中央民族工作会议指出：坚持开发者付费、受益者补偿、破坏者赔偿的原则，加快建立生态建设和环境保护补偿机制，对在建立自然保护区、重要生态功能保护区和生态环境建设等方面做出贡献的民族地区给予合理补偿，并切实解决当地农民增收和长远生计问题。
我国民族地区是我国重要的生态屏障。《全国生态环境建设规划》确定的4个重点地区，全部在民族地区。全国大大小小的自然保护区，也有许多分布在民族地区。我国的大江大河源头和上游地区基本上都在西部民族地区。西部民族地区同时又是我国资源与能源的战略基地。作为重要的生态功能区，脆弱的生态环境一旦遭到破坏，整个生态系统将受到严重破坏。保护好了，全国受益；被破坏了，殃及全国。长期以来，这些地区向发达地区输出资源，承担生态破坏的成本，却没有得到相应补偿，导致地区生态不断恶化。截至目前，西部地区水土流失面积已达280多万平方公里，占全国水土流失总面积的70%以上。同时，这些地区恰恰多是贫困地区，居住着相当比例的贫困人口。他们急于摆脱贫困、改善生活的种种努力，又往往直接构成对脆弱生态环境的破坏。当他们没有更好的可持续的生产生活方式可供选择时，要求他们安于贫困、要求他们抑制思富求变的愿望，接受诸多限制是不公平的，也是难以奏效的。
为再造一个山川秀美的西部”，我国在实施西部大开发战略以来的五年中，先后投入1100多亿元用于西部地区的生态补偿。目前，对西部地区生态补偿形式主要有三种：一是财政补偿，例如国家对西部重要生态区域实行财政转移支付；二是项目支持，包括退耕还林工程、三北”及长江流域防护林体系建设工程等多个生态环境保护和建设项目等；三是征收生态环境补偿费，设立固定的生态环境保护与建设的资金渠道，实现保护资金的规范化、社会化和市场化。
加快建立生态建设和环境保护补偿机制，是促进民族地区加快发展、维护国家生态安全的有力保障和长远之计。近年来，谁受益、谁补偿”、谁破坏、谁恢复”、谁污染、谁治理”的生态补偿原则开始获得社会认可，建立下游地区对上游地区、受益地区对受损地区、城市对乡村、富裕人群对贫困人群的生态补偿机制，有利于平衡各方利益。根据《国务院实施〈中华人民共和国民族区域自治法〉若干规定》，国家征收的矿产资源补偿费在安排使用时，要加大对民族自治地方的投入，并优先考虑原产地的民族自治地方。政府依照开发者付费、受益者补偿、破坏者赔偿的原则，从国家、区域、产业三个层面，通过财政转移支付、项目支持等措施，对在野生动植物保护和自然保护区建设等生态环境保护方面作出贡献的民族自治地方，给予合理补偿。
要学习和借鉴国内外成功经验，来推动民族地区生态建设和环境保护补偿机制的尽快建立。目前，世界银行、联合国开发署、世界自然基金会等国际组织在生态环境税费制定和实践、生态保护的市场化政策、流域生态补偿机制等方面都积累了很多经验。我国的一些省区也积累了一些好的经验。如浙江省，自2004年作出发挥浙江生态优势，创建生态省，打造‘绿色浙江’”的战略部署后，在逐步建立生态补偿机制方面加大了工作力度，取得了较好效果。浙江省的江河源头、饮用水源涵养地区、自然保护区、森林和生物多样性保护地区等重要生态功能区，大都分布在西南部山区，与欠发达地区基本重合。这些地区承担着十分重要的生态保护和建设任务，当地的经济社会发展也受到更多条件的制约。该省在逐步建立生态补偿机制的工作中，将促进环境保护、生态建设与区域经济协调发展结合起来，对欠发达地区采取了一系列帮扶措施。一是加大财政转移支付力度。环保资金向重要生态功能区倾斜，发挥财政资金在生态补偿中的激励和引导作用。2004年，省级财政通过两保两挂”、两保一挂”向扶持欠发达地区和重要生态功能区的市县转移支付达39.67亿元；省财政还设立了多个专项资金，根据环境与生态保护建设的需要，对国家级重点防护林和特种用途林、省重点生态公益林实行财政补助，截至目前，该项补助金额已累计超过两亿元；2000-2003年，安排对重点环境整治与保护项目方面的专项资金近15亿元，并对欠发达地区和重要生态功能区实行倾斜政策。二是下游地区给上游地区返利税，上游地区下山异地搞开发。在县域范围内，一些县市出台政策，规定上游地区乡镇的招商引资项目进入县（市）开发区，产生的利税地方所得部分全部返还给上游乡镇。在省域范围内，景宁畲族自治县与宁波鄞州区建立的景鄞扶贫经济开发区”每年可获得返还利税5000多万元。三是推行资源使用权和排污权交易制度，积极探索生态补偿的市场化运作机制。东阳市与下游义乌市之间在全国首创了水权交易。经测算，东阳市通过节水工程增加水库1立方米水资源的成本是1元，而义乌市在境内通过修建水库等方式增加1立方米水资源的成本是6元，最终双方以4元/立方米的价格成交。嘉兴市秀洲区于去年开展了排污权交易试点。
